科技类 DeepMind通过蛋白质折叠AI解决了已有50年历史的“巨大挑战”

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欧洲生物信息学研究所的戴姆特·桑顿教授在电话中告诉记者:“蛋白质是最美丽,最华丽的结构,准确预测其折叠方式的能力确实非常非常非常具有挑战性,并且已经占据了很多年。”

英国研究实验室DeepMind的“ AlphaFold”人工智能系统参加了由CASP(结构预测的关键评估)组织的竞赛。这是一个社区实验组织,其任务是加快解决一个问题:如何计算蛋白质分子的3D结构。

CASP一直在监视该领域的进展25年,将提交的竞赛与“实验性金标准”进行了比较。周一,该公司表示,DeepMind的AlphaFold系统在蛋白质结构预测中达到了无与伦比的准确性。

“ DeepMind取得了进步,” CASP主席John Moult教授在公告发布前的新闻发布会上说。“ 50年来,计算机科学领域的巨大挑战已得到很大程度的解决。”

穆尔特补充说,在药物设计领域以及新兴的蛋白质设计领域,“有一些重大影响”。

DeepMind拥有约1000名员工,几乎没有收入,已成为由Alphabet(Google的母公司)提供支持的昂贵公司。但是,它已与Facebook AI Research,Microsoft和OpenAI等一起成为全球AI竞赛的领导者之一。

Google首席执行官Sundar Pichai在Twitter上对这一突破表示欢迎。

DeepMind联合创始人兼首席执行官Demis Hassabis在电话中说:“ DeepMind的最终愿景一直是构建通用AI,然后通过极大地加快科学发现的步伐,使用它来帮助我们更好地了解周围的世界。 ”

科技类 DeepMind通过蛋白质折叠AI解决了已有50年历史的“巨大挑战”-第1张图片

该公司于2014年被Google以6亿美元的价格收购,该公司以创建可以玩诸如Space Invaders和古代中国棋盘游戏等游戏的AI系统而闻名。但是,它始终表示希望产生更多的科学影响。

哈萨比斯说:“游戏是有效开发和测试通用算法的绝佳平台,我们有一天希望我们能将其转移到诸如科学问题之类的现实世界中。”“我们认为AlphaFold是该论文的第一个证明点。这些算法现在已经变得足够成熟和强大,可以应用于真正具有挑战性的科学问题。”

DeepMind还参加了2018年的CASP蛋白质折叠竞赛。尽管当时的成绩令人印象深刻,但DeepMind的AlphaFold负责人John Jumper表示,研究小组知道这是生产某种具有“非常强的生物学相关性或与实验竞争的产品的某种方式” 。”

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然而,今年的比赛并非一帆风顺,而Jumper说DeepMind进行了三个月而没有任何进展。“我们会坐在那儿,担心会耗尽数据吗?”他说。

即使临近比赛截止日期,Jumper和他的团队仍然担心他们可能会犯错。他说:“机器学习系统中总会出现错误。”

但是他们的努力似乎已见成效。他说:“我们真的认为我们已经建立了一个为实验生物学家提供正确且可操作的信息的系统。”“拥有结构的原因是要了解自然世界的某些知识,然后提出更多问题。我们认为我们已经建立了一个可以真正帮助人们做到这一点的系统。”

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